草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿机系统软件最先见的病毒一种。肾企业中CaOx硫化锌过过剩堆积会使得肾小管細胞损害和凋亡，于是使得肾结石的变成。短链脂肪多酸酸由肠胃内水解酸化池细茵面团发酵饮食营养纤维素带来，一方面在产品局部肠胃防御系统软件中激发用用，同时还在机系统软件关卡上也激发用关健用。这之中，丁酸是最雄厚的短链脂肪多酸酸，享有消除炎症和免疫力仰制用,本实验研究方案丁酸对CaOx肾结石的用举例意向靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山门诊泌尿美容外科吴忠客座教授、周子健搏士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠副教授、周子健硕士生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱海洋生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网络数据药剂学学服务培训，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

文章内容种类：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 朋友计量单位：华山医疗机构 研究方案相亲对象：大鼠、HK-2上皮细胞 好友分组短信：对比组（Con）、模型工具组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱能提供技术工艺：数据网络临床药理学检测工具

工作思路方案图

科学研究导致

探究人工首要建设方案大鼠模式化，经由生理方面生化模式质量指标和组织安排病症学脱色等探究具体方法发现丁酸都可以降低CaOx模式化大鼠肾CaOx晶状体的演变成和挫伤，改善效果CaOx模式化大鼠的支原体感染挫伤和脱色元素的优化表述。与此同时，丁酸还可阻止草酸诱导型的HK-2内部挫伤、脱色应激状态和内部凋亡。 为洞察研究解析一下丁酸型式和靶dna网路，深入研究解析的人员从PubChem得丁酸和丁酸酯的二维和3d型式（图1A）。凭借PharmMapper数据解析文件报告库和Uniprot数据解析文件报告库操作后共挑选出11九个丁酸靶dna供进步骤研究解析。将dna全部接入STRING数据解析文件报告库，来进行PPI网路研究解析。Cytoscape明确了编排的前20的核心区站靶dna的详细介绍网路图，属于CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这一些核心区站dna与网路中的的dna均展示出必要的关于系性，阐述这一些dna也许 充分产生着信息化用。GO和KEGG研究解析阐释了丁酸核心区站dna的关于系途经和生物体制品学功能键（图1C）。核心区站dna重点与类固醇抗生素回应、空气阳极氧化应激发生反应性回应、活力氧受损细胞对类固醇抗生素兴奋的反馈以其对酸碱性生物体物的反馈关于。上面所论，这一些核心区站dna重点积极参与了空气阳极氧化应激发生反应性和对活力氧的生物体制品反馈历程，是肾结石达成考核机制中至关为主要的途经，这表示丁酸也许 在肾结石中充分产生为主要用。

图1| 丁酸机构与靶基因组线上浅析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进几步探秘丁酸对CaOx肾结石或许切靶遗传什么是DNA，深入分析探讨方案师利用GEO数值库对GSE73680中身心健康差表与CaOx肾结石求美者的遗传什么是DNA不同之处去了深入分析探讨方案。差表组与CaOx结石求美者的特殊性不同之处把你想呈现出来遗传什么是DNA（DEGs）肿瘤筛查要求为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个遗传什么是DNA会发生特殊变化规律，这其中3379个（89.4%）遗传什么是DNA把你想呈现出来调整，404个（10.6%）遗传什么是DNA把你想呈现出来调整（图2A）。对DEGs去聚类分析浅析法浅析，热图表示了前10个被选中DEGs的二维分出层次聚类分析浅析法表现形式（图2B）。最后，深入分析探讨方案师用GeneCards数值库人力技术鉴定了370个有可能与CaOx肾结石一些的遗传什么是DNA，排名第一前20位的精准预测遗传什么是DNA下列不属于一些性评分系统如图已知2C随时。为了让实现丁酸根治CaOx肾结石的关键所在靶点，深入分析探讨方案师将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石一些遗传什么是DNA净化处理实现了个Venn图。终于，CYP2C9被判定为丁酸应响CaOx肾结石的潜在性的靶点(图2D)。显然，深入分析探讨方案师还去了丁酸与CYP2C9的原子合作，CYP2C9的多个胺基酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸间接角色，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在回收利用网上药学学分析CYP2C9是丁酸危害CaOx肾结石的靶人类基因后，深入分析人数还可以通过癌人体细胞实验性否认了CYP2C9可削减草酸诱导型的HK-2癌人体细胞的ROS平行、疾病破损和凋亡。

图2| 绝大多数据库整合研究分折CYP2C9是丁酸用途于CaOx肾结石的靶人类基因

研究探讨毕竟

本探析1看见丁酸在身体内部和身体内部均能促使CaOx肾结石3d模型的被硫化应激状态反应和宫颈宫颈真菌感染挤压伤，随着能够 微信网络数据药学学挑选获取丁酸应响CaOx肾结石的隐藏靶点——CYP2C9，后来能够 受损内部实验操作印证CYP2C9在草酸盐促进的HK-2受损内部ROS水准、宫颈宫颈真菌感染挤压伤和凋亡。以上看见揭示丁酸可能性能够 促使CYP2C9来促使CaOx肾结石的被硫化应激状态反应，减弱宫颈宫颈真菌感染挤压伤。这一项过程中中拜谱生物体技艺具备了微信网络数据药学学技艺精准产品，再者拜谱生物体技艺可的提升稳定建全的表观遗传组学、血清质组学、代谢率组学等多个学护肤品及技艺精准产品，祝贺拨打电话质询！ 参照论文：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.