
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC免疫抗体丰度MHC举例说明切合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到抗体肽字段并且翻译资料后突显图片信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo从头到尾测序技术应用,不依赖现有数据库,高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且充实的数据统计浅析介绍为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递恶性肿瘤抗原的方法
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01 规则学习
经典文章考题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
展现自媒体:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)不是种核效果血清,在淋巴肿瘤中习惯性过表达出,做以为淋巴肿瘤出现的驱程原则。日前,靶向疗法XPO1的小原子核正被可作临床护理防癌肿瘤药物。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫细胞肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 一类原于XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 恶性肿瘤-免疫抗体改善
句子题目的:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
说出杂物:Nature Communications IF:16.6 2023
恶意胸膜间皮瘤(MPM)是种继发性不合理的侵蚀性性淋巴肿瘤。因替换成的治療细则缺失较果,这样迫切希望要有新的治療攻略 。上述情况其T体细胞侵及,小说拜谱生物有效市场理论MPM是个适合的的治療性癌病狂犬疫苗的目标值。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用应用场景质谱的免疫抗体肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶意胸膜间皮瘤免役肽组学检验
03 杆菌mRNA防疫针搭建
散文试题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
发表论文期刊:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过应用于质谱的免疫性肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌病毒感染的Hela神经细胞膜和HCT-116神经细胞膜中签别MHC I呈递的抗原肽。
拜谱总结
抗体肽组学是核营养物质组学的这个怏速进展的构成,它致力于实验抗体系统中由关键组识相融性复合材料体(MHC)或人类白内部计数系抗原(HLA)分子结构呈递的抗体肽。这样的抗体肽是内部系表面能呈递的肽段,能被T内部系设别,最后闪避抗体现象。系统设计质谱的抗体肽组学就已经将成为监定MHC核血清呈递肽的金细则形式,能可以监定差异生理问题和病检工作状态下差异组识和内部系型号中的抗体肽组,列举实体的瘤或宏病毒细菌感染的内部系。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的淀粉酶组学、代谢率组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫力肽组检则服务培训,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,要精准的且直接的提拱抗体性肽回文序列,出现较多非关键抗体性肽,经过层层的需求出靠普新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
参考资料文章
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y