
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化淡化球蛋白组学产品,实现1000+深奥度呈现位点检测,保持稳定显现著名靶点,全八卦方位生信阐述解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“挖掘”到“检验”全程序精准服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、试验操作流程
02、实测值数据分析
03、经“点”复现
在实测值数据分析中,检测出多家资料中简报的精品靶点基本衣康酸掩盖位点,如1个被看到的衣康酸共价掩盖球血清酶KEAP1,另外 糖酵解信号通路中的3个重点酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,或者炎性小体组建球血清酶NLRP3和体细胞挫裂期间中的重点球血清酶RIPK3等,其质谱图有以下图如图。
04、好产品特殊性
1.多种质控
商业性的化活性朋友探头孵育、SDS-PAGE检查、WB认可、样本量涉及到性剖析等多方面位检查,保证大型项目没想到准确性。2.高的性能质谱医疗仪器系统
在Orbitrap Astral全新一带高粪便质谱仪加持咒下,完成衣康硝化作用遮盖位点及蛋白质评定新高度,保驾护航专业探索新发展。3.全流程图一趟式服务管理
针对拜谱生物制品改进的试验网络平台,可展示“生殖细胞提升→电极孵育→WB在线加测→艰深度衣康碱化修饰语在线加测→专享生信解析→某些位点PRM效验”全步奏产品,省时省事更省事。05、定量分析主要内容(要素)
06、用放向
PART 2、参考文献分享和交流
资料一
日语副标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
英文版宝贝标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
钻研东西:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
专著二
用英文怎么说标题格式:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
中文名网站标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
钻研知识:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、范例诞生工作思路
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具备有不强的底物依照意识,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱生物制品衣康硝化作用掩盖组测量数据源中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康过酸突显(以下几点图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱个人总结
看作TCA间歇中的里头产生物,衣康酸缓解产生、天然免疫力检测和感染之前的主动效应,为冶疗天然免疫力检测感染性皮肤妇科疾病保证了充当冶疗方案。衣康酸设备构造中的亲电性α,β-不过饱和羧酸设备构造能对蛋清质上的化学活化半胱氨酸残基完成烷基化装饰语(迈克尔加上发应),这一个翻译工作后装饰语被叫作“衣康酸装饰语(itaconation)”,以致影向蛋清质模块,监测天然免疫力检测对答和产生手段,为各种各样皮肤妇科疾病中成药研发培训保证新一个构想。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应表达蛋白酶组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物中医药学绝对的按量靶向疗法代谢率组(QMT1000)或动能消化吸收靶向药物消化吸收组好产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
基准学术论文
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.